Las proteínas quinasas que fosforilan proteínas en las células eucariotas pertenecen a una gran familia de enzimas, las cuales contienen un dominio catalítico de 250 aminoácidos (quinasas) similar. Los diversos miembros de la familia contienen diferentes secuencias de aminoácidos a ambos lados del dominio quinasas y a menudo dentro del dominio tienen diferentes secuencias formando asas.
Algunas de estas secuencias adicionales de aminoácidos permiten que cada quinasa reconozca específicamente el conjunto de proteínas que fosforila . Otras secuencias únicas permiten que cada quinasa esté regulada de forma diferente, de manera que puede ser activada o inhibida en respuesta a diferentes señales específicas.
Comparando las diferencias en la secuencia de aminoácidos entre los miembros de una familia proteica puede construirse un “árbol evolutivo”, que al parecer refleja el patrón de duplicación génica y de divergencia que ha dado lugar a la familia. No resulta sorprendente que a menudo las quinasas que tienen funciones relacionadas se localicen en ramas vecinas del árbol. Por lo tanto todas las proteínas quinasas que participan en procesos de señalización celular fosforilando cadenas laterales de tirosina se hallan agrupadas.